春回大地，慢羊羊村长迎来了他的百周年庆典。然而，在这个喜庆的日子里，慢羊羊的坐骑老蜗牛却突然病倒了。经过检查，村长发现这是一种危险的病毒引起的病变，他心急如焚，决定亲自潜入蜗牛体内消灭这种病毒。
小羊们得知这个消息后，也意识到事情的严重性。他们决定代替村长去蜗牛的身体上消灭病毒。然而，就在他们准备出发的时候，灰太狼偷偷地听到了他们的计划。为了阻止小羊们的行动，他也打算进入蜗牛体内捕猎小羊。
喜羊羊、沸羊羊、懒洋洋和美羊羊一行四人来到了蜗牛的两只触角上。他们还未来得及弄清楚这是哪里，就被白菌士兵强行征召入伍，成为了士兵。更令他们惊讶的是，他们不需要经过新兵训练，直接就被拉上了战火连天的前线上。
在军营内，他们得知了一个惊人的事实：他们身处的地方是位于蜗牛触角上的细菌国度——白牛国。近期，这个蜗牛世界的平静被打破，每天都发生地震。白牛国的国王断定，这一切一定是来自另一只触角上的黑菌王国——黑牛国搞的鬼。于是，为了消灭邪恶的黑牛国，制止这场细菌感染，白牛国征集了全国兵力，发动了战争。
在这个紧要关头，喜羊羊和他的朋友们决定参加到白牛国的军队中，共同对抗黑牛国的细菌。他们决心要保护这个和平的世界，不让战争再次席卷而来。
