迪迦一词在印度尼西亚语中意为神圣的数字3。大约三千万年前，人类正处于超古代文明时期。在这个时期，守护人类的巨人们发生了内战。原本地球上最强大的黑暗战士迪迦，在受到幽怜的感动后，选择成为光之战士，使自己的黑暗力量长眠。

奇杰拉花朵盛开，人们全都陷入了因奇杰拉花粉产生的幻觉，认为已经不再需要巨人。然而，光之巨人不能干涉人类的选择。于是，巨人将自己战斗的躯体隐藏在金字塔后，化作光离开了地球，回到了自己的故乡。

邪神加坦杰厄带着毁灭性的黑暗降临，超古代文明随之毁灭。21世纪初期，地球不再受到侵略和战争的威胁，人类期盼已久的和平终于到来。地球防卫军也因此完成了历史使命，TPC(地球和平联合组织)成立，人类迎来了新的时代。

然而，正如超古代警卫团团长幽怜所预言的：“哥尔赞”和“美尔巴”出现了。在怪兽攻击的目标——金字塔内，发现了3座巨大的石像。2座巨石像被怪兽摧毁。在这紧要关头，因为继承了超古代战士的基因，可以与金字塔的迪迦石像结合在一起的大古队员全身被光所包围，并融身于剩下的石像内——迪迦·奥特曼苏醒了。