《刀剑神域第三季》的最终篇章是《爱丽丝篇》，讲述了桐人、尤吉欧和爱丽丝的故事。在故事中，桐人和尤吉欧打败了最高祭司阿多米尼斯多雷特，结束了战斗后，爱丽丝在故乡卢利特村生活。在她的身旁，是失去了挚友，自己也失去了手臂和心的桐人。献身般支撑着他的爱丽丝，丝毫没有保留像以前一样作为骑士的心。然而，通往将Underworld(地底世界)全境引向悲剧的“最终压力测试”的倒计时，却毫不留情地推进着。仿佛与之相呼应一般，在“黑暗领域”的深处，暗黑神贝库达复活了。他率领暗黑军团，为了得到“光之巫女”，开始向“人界”进攻。指挥“人界”军队的贝尔库利等人，决心与“黑暗领域”的军队展开前所未有的大战。但在他们身旁，并没有发现爱丽丝，以及拯救了“人界”的两位英雄的身影。