胡佛是美国历史上最有权势的联邦调查局(FBI)局长，也是一位备受争议的人物。他在担任该职位长达48年的时间里，掌握着一个被称为“秘密档案库”的资料库，这些资料库中包含了许多关于美国政治家、企业家和名人的黑料。因此，无论是现任总统还是前任总统，都不敢对胡佛采取任何不利行动。
胡佛与肯尼迪总统在一起
评价胡佛，实际上是在评价两个人：一个是国家英雄，他的调查局给了美国以秩序和繁荣还有尊严。而他在一些知情者眼中，他是一个心狠手辣、机关算尽、无人敢惹的危险人物。在他担任联邦调查局局长的48年时间中，历任美国总统都想把他从调查局的宝座上请下来，可任何总统都不敢，因为胡佛有一个“秘密档案库”。
在那个时代，不论是达官贵人还是平民百姓，似乎永远都生活在胡佛和他领导的联邦调查局的非法监视和骚扰之中。有这样一个场面使人不寒而栗--一名凶悍的参议员，在被胡佛一阵咬耳朵之后，立即驯服得如同软脚蟹。
尼克松与米切尔关于胡佛的对话
美国历史上著名的总统尼克松在1971年10月的时候曾与白宫的法律顾问米切尔之间发生过一段关于胡佛的对话：“有许多理由，胡佛应当辞职，他应当离开那里。但现在也许我可以叫他来跟他谈谈让他辞职吧？有些问题......如果他辞职他应当出于自愿这就是我们难办的原因我想他会待在那里待到100岁”米切尔回答说：“他会待在那里直到埋葬在那里”尼克松接着说：“我们应当避免他在闹得满城风雨的情况下离开？他会搞得天都要塌下来连我也遭殃？”很多美国评论家都断定尼克松在近代美国总统里是“一代枭雄”，但从上面谈话中可以看到一谈到胡佛他就开始变得语无伦次了
据知情者透露，胡佛手里关于尼克松的档案可谓“等身”。其中大多数是关于他同白领犯罪分子的联系以及非常可疑的商业交易。这些档案都放在一个只有胡佛才知道的地方无论是他还是尼克松都知道只要尼克松略微不友好这些档案就会从不知名的地方飞出来置尼克松于死地。在这些档案中还有一份材料是让很多人都想不到的那就是他同“一个异国女郎的关系”
958年，尼克松还是副总统的时候，他遇到了20岁的香港导游小姐刘梅丽。他们一见如故，不久后尼克松就飞去香港与她重逢。从1964年到1966年，他们每年都见面，当时刘梅丽在希尔顿饭店的酒吧当服务员。
据当时在香港工作的美国特工口供显示，尼克松同刘梅丽的关系一度引起了安全问题。美国安全顾问丹·格罗夫说：“有一天上午，我在美国的一个接头人对我说，他的一个线人看见刘梅丽去见尼克松了。他认为，我应当注意这一点，因为人们怀疑她是间谍，她认识许多美国海军军官。他说，他知道尼克松作了一个绝密报告，这使他同刘梅丽的接触具有危险性。”
这段文字讲述了尼克松在对全国发表的官方讲话中，称胡佛先生是“传奇”，并提到了胡佛对历界总统的情报搜集。其中，胡佛对肯尼迪的情报搜集更是无孔不入。在胡佛局长的绝密档案库里，有一份关于肯尼迪与已婚女间谍英格的私情详细报告，以及一些秘制的磁带，里面是肯尼迪与女间谍的对话。事实上，在1942年的时候，约翰·肯尼迪还只是一名海军中尉，他与那位女间谍的对话传到胡佛耳朵里后，胡佛立即向白宫作了汇报，并建议把肯尼迪中尉调到国外。不久，肯尼迪被调到了太平洋战场。1943年，他所指挥的“PT-109”号鱼雷快艇被日本人的鱼雷击沉后，他以惊人的勇气带领下属泅渡获生。在经历了七个月的治疗后，肯尼迪拄着拐杖回到美国，成为名扬全国的战斗英雄。让肯尼迪大惑不解的是，自己原本在国内干得好好的，为何会突然被送上前线呢？直到他当上美国总统之后才知道，原来是胡佛对“间谍嫌疑分子”的调查成全了他的英雄之旅。
根据《傀儡王：J·埃德加·胡佛的秘密一生》的作者所说，胡佛搜集情报相当繁多，有一些秘密文件中甚至包括一些人物的裸照。他有很多人的裸照，这是他为自己搜集的下流文件。他对色情文学绝对有很大兴趣。当然，他可以堂而皇之地辩解说，自己需要知道事情的真相以便采取对策。
此外，胡佛曾严肃要求好莱坞听从自己的命令，摄影棚里拍摄犯罪片时都必须遵循胡佛的意志。“每个细节都在他的监视之下。他对每部电影、每个场景、每个脚本，每名演员都进行审阅。每件事情都要经过他的批准。”在电影《国民公敌》拍摄时，他给演员詹姆斯·卡格尼的唯一建议就是“在结尾你必须要死掉，因为我不想看到任何骗子活在这个世界上”。
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首先，通过这些手段所得来的文件被胡佛分门别类，主要包括“淫秽档案”“性越轨档案”“官方机密档案”“个人机密档案”“6月邮件”等几个大类，还有一些无法分类的档案，大都收存了中央档案系统以外的调查局非法获得的汇报材料等。
其次，胡佛的离世让很多人额手相庆，但这些人并没有在公众场合发表对胡佛不利的言语。只有被胡佛调查过，并且死因可疑的马丁·路德·金的遗孀站了出来，对胡佛做了一个比较中肯的评价。她说：“一个可悲和危险的环境终于离我们而去了。在胡佛的统治之下，FBI所搜集的文件里充斥着谎言，据说还有一些政府高官，包括美国总统在内的丑闻。这种爆炸性的秘密必须以适当的方法被掩盖，而黑人和黑人自由运动就成了这种不名誉活动的靶子。”
这位妇女所指的秘密文件据称包含着许多肮脏的丑闻。然而，正是这些丑闻才让胡佛有了权力来源。胡佛处理这些秘密文件的方式也相当特别。他从来不会向人透露这些丑闻的细节，而只让那些可能受丑闻连累的关键人物知道自己手中掌握着他们的秘密。“胡佛知道怎样保守秘密，这是他成功的真正原因。他不仅知道这些秘密，而且没有人知道他究竟知道哪些秘密。没有一位总统敢解雇胡佛，因为没有一位总统知道胡佛究竟知道些什么。这对总统来说是最大的恐吓。”无疑，胡佛所掌握的这些秘密文件对一些人来说是一种无声的恐吓：只要这些消息没有被公众知道就绝对有效。在近半个世纪的时间里，胡佛确保这些秘密没有一个字被走漏。无一例外。事实上，这些文件被保存得相当机密，即使是FBI特工都不敢肯定它们是否真的存在。但是，胡佛和他希望某人知道的某人知道，就足够了。
然而，正应了一句古语，控制别人的人必将也被别人控制。胡佛就是这样一个人，他虽然掌握了无数秘密文件，而让某些人断定他是一个危险的人。而他自己的一些肮脏的丑闻也被别人抓在了手里。
胡佛的许多手下都反映说，他们的局长不仅读《花花公子》，而且爱看黄色电影。胡佛局长曾规定过，联邦调查局搜查行动中查获的淫秽材料，必须马上送到他的办公室。
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胡佛是FBI历史上最有权势、最有争议的领导人之一。他在性取向方面的问题一直是一个备受关注的话题。虽然FBI中有人知道他是同性恋，但没有人敢说出来，更没有人敢去对别人说。因为“他的这支队伍中所有人都只效忠他一人。他们从来不听首席检察官的命令，也不听美国总统的命令，他们只听胡佛的命令” 。
