最终决战后过了四年，建立地球联邦政府的人类为了追求更进一步的国家间之统合以及人类意识的统一，在联合正规军之外设立了独立治安维持部队“A-Laws”。这个组织的目的是对所有危害联合的势力与主义、思想等进行非人道的压迫，例如反联合的国家、Katharon以及再次出现的天人。沙慈·克罗斯洛德在遵守与路易丝·哈勒维的约定、朝着成为宇宙技术员之路前进的过程中，也身不由己地被联合政府的变革所卷入。另一方面，在4年前的最终决战中存活下来的刹那·F·清英默默注视着因为受天人影响而变革的世界所产生的变化。
打倒监视者亚历杭德罗·科纳后，他梦想着能有一个不再有纷争的和平世界。可是，他所看到的却是一个由“A-Laws”所制造的扭曲的和平，依然持续着歪斜的现实。于是他决定与能够改变世界的力量——“敢达”再次一同战斗。
在这个再次开始变化的世界中，刹那和沙慈的未来将朝向何方？他们的选择将如何影响整个宇宙的命运？这些问题将在接下来的情节中得到解答。
