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虾夷扇贝闭壳肌呈现橘红色是由于类胡萝卜素在虾夷扇贝闭壳肌中累积造成的，但调控类胡萝卜素累积的机制还不清楚。本研究利用抑制性差减杂交技术(suppression subtractive hybridization,SSH)对虾夷扇贝闭壳肌颜色差异相关基因进行筛选和分析。以虾夷扇贝红色闭壳肌cDNA为tester,白色闭壳肌cDNA为driver,构建正向差减文库；以虾夷扇贝白色闭壳肌cDNA为tester,红色闭壳肌cDNA为driver,构建反向差减文库。利用454测序技术对筛选得到的特异性cDNA进行测序分析，正向差减文库测序得到2640条序列，拼接得到50个contigs;反向差减文库测序得到2496条序列，拼接得到187个contigs。经过同源性分析，红柱特异性序列中获得了铁蛋白、紧密连接蛋白、锚蛋白、锰超氧化物歧化酶、磷酸葡萄糖变位酶等与类胡萝卜素累积上调相关的共27种基因，涉及渗透调节、细胞连接、肌肉运动、活性氧清除等方面；白柱特异性序列中获得了多聚泛素、PDZ结构域蛋白、溶质载体等与类胡萝卜素累积下调相关的共121种基因，涉及蛋白降解，信号传递，转录调控等方面。 本研究结合红白柱虾夷扇贝转录组454测序结果，筛选得到了一大批在红白柱虾夷扇贝之间差异表达的基因。根据测序数据中基因的丰度水平对这些基因的差异显著性进行分析，并且通过查阅文献，了解相关基因的功能，最终通过候选基因法，我们在众多的差异表达基因中选择了三种清道夫受体SRB1、SRF2以及SRCR作为候选基因进行研究。选取清道夫受体作为候选基因进行研究，并对其在红白柱虾夷扇贝各组织中的表达量水平进行检测，初步阐述了其在虾夷扇贝中的组织表达规律。根据结果推测在虾夷扇贝橘红色闭壳肌类胡萝卜素累积和转运的过程中，清道夫受体有可能是调节类胡萝卜素吸收的关键基因。 本研究为虾夷扇贝闭壳肌类胡萝卜素累积相关通路的探索提供了重要的理论依据，有助于类胡萝卜素累积相关机制的进一步研究。
